El PPSQ es un instrumento para determinar las secuencias de aminoácidos de proteínas y péptidos, que combina una sección de reacción de Edman con un cromatógrafo de líquidos de alta resolución (HPLC). Hay 2 tipos: el PPSQ-51A, que está equipado con un reactor, y el PPSQ-53A, que está equipado con tres reactores. En el PPSQ-53A, el análisis continuo de las secuencias de aminoácidos de múltiples muestras se puede realizar una tras otra. En la sección de reacción de Edman, los aminoácidos se escinden en orden del extremo N-terminal de una proteína realizando repetidamente la degradación de Edman, y se derivatizan. Como resultado, se producen aminoácidos PTH estables. Los aminoácidos PTH se inyectan en línea en la HPLC y se realiza el análisis. Los datos de HPLC se guardan en la PC, y el software de procesamiento de datos se usa para procesar los cromatogramas. Luego, el software de estimación de secuencia de aminoácidos se utiliza para identificar los aminoácidos y estimar las secuencias.